Báo cáo kết quả năm 2013 nêu rõ, Hội đồng khoa học các cơ quan Đảng Trung ương đã bám sát chương trình làm việc của Ban Chấp hành Trung ương, Bộ Chính trị, Ban Bí thư, đặc biệt là chương trình công tác của các Ban, cơ quan Đảng Trung ương. Hội đồng đã hoàn thiện và nâng cao chất lượng các hoạt động nghiên cứu khoa học từ khâu tổ chức, quản lý và ứng dụng các kết quả nghiên cứu của các đề tài, đề án. Từ đó, tổ chức thành công nhiều cuộc hội thảo, tọa đàm khoa học, trên cơ sở đó đã đúc kết lại thành các báo cáo tư vấn riêng trình Trung ương, góp phần xây dựng các nghị quyết, chỉ thị của Đảng về các lĩnh vực có liên quan. Hội đồng đã mở rộng, phát huy hiệu quả thông tin tuyên truyền, thúc đẩy mạnh mẽ hoạt động thông tin khoa học. Đồng thời, duy trì và phát triển các mối quan hệ phối hợp với các cơ quan, bộ ngành.

Tuy nhiên, Báo cáo cũng chỉ rõ những hạn chế, thiếu sót trong hoạt động nghiên cứu khoa học của các cơ quan Đảng Trung ương. Chất lượng thuyết minh một số đề tài, đề án còn hạn chế; chưa có những đề tài, đề án mang tính đột phá liên quan trực tiếp tới những vấn đề quan trọng, cấp bách đặt ra đối với công tác tham mưu chiến lược. Đã có sự đổi mới trong công tác quản lý hoạt động nghiên cứu khoa học song chưa nhiều, còn nhiều đề tài, đề án chậm tiến độ. Thông tin về đề tài, đề án, việc ứng dụng kết quả nghiên cứu chưa mang tính khả thi và hiệu quả. Chế độ thông tin giữa các bộ phận trong cơ quan Hội đồng có lúc chưa thông suốt. Việc phối hợp nghiên cứu khoa học với các bộ, ngành… còn hạn chế.

Phát biểu chỉ đạo Hội nghị, đồng chí Đinh Thế Huynh, Ủy viên Bộ Chính trị, Bí thư Trung ương Đảng, Trưởng ban Tuyên giáo Trung ương đã ghi nhận, đánh giá cao và biểu dương những kết quả đạt được trong hoạt động nghiên cứu khoa học của Hội đồng Khoa học các cơ quan Đảng Trung ương trong năm 2013.

Đồng chí Đinh Thế Huynh nhận định: “Công tác nghiên cứu khoa học của các cơ quan Đảng Trung ương ngày càng nâng cao tính thiết thực, các đề tài, đề án khoa học hướng vào những vấn đề cấp thiết đang đặt ra, góp phần nâng cao chất lượng công tác tham mưu của các cơ quan Đảng Trung ương”.

Đồng chí Đinh Thế Huynh nhận định: Nghiêm túc nhận rõ những hạn chế, thiếu sót trong hoạt động nghiên cứu khoa học của các cơ quan Đảng Trung ương cho thấy, chất lượng và tính hiệu quả trong nghiên cứu khoa học của một số đề tài, đề án chưa cao. Việc đổi mới công tác quản lý và hoạt động nghiên cứu khoa học chưa được nhiều; còn nhiều đề tài, đề án chậm tiến độ. Việc nghiệm thu kết quả nghiên cứu chưa thực sự đề cao tính ứng dụng, tính khả thi và tính hiệu quả…

Theo tinh thần Nghị quyết Trung ương 6 (khóa XI), đồng chí Đinh Thế Huynh nhấn mạnh và gợi ý trọng tâm của năm 2014 mà Hội đồng khoa học các ban Đảng Trung ương cần hướng tới là:

Một là, các hoạt động của Hội đồng cần tiếp tục bám sát chương trình làm việc của Ban Chấp hành Trung ương, Bộ Chính trị, Ban Bí thư và các cơ quan Đảng Trung ương bởi năm 2014 là năm quan trọng của việc thực hiện Nghị quyết Đại hội XI của Đảng. Trọng tâm là phục vụ cho công tác tổng kết một số vấn đề lý luận và thực tiễn qua 30 năm đổi mới, nâng cao chất lượng toàn diện hoạt động của Hội đồng, góp phần tư vấn cho các cơ quan Đảng Trung ương và tiếp tục triển khai thực hiện các Nghị quyết của Đảng, Hiến pháp sửa đổi, chuẩn bị Đại hội Đảng các cấp, tiến tới Đại hội XII của Đảng. Trên cơ sở các hoạt động nghiên cứu khoa học, các ban, các cơ quan Đảng Trung ương tham mưu cho Ban Chấp hành Trung ương, Bộ Chính trị, Ban Bí thư tiếp tục đổi mới tư duy, quy hoạch đường lối, hoàn thiện chủ trương, chính sách phù hợp với yêu cầu phát triển đất nước.

Hai là, các cơ quan Đảng Trung ương, nhất là các đồng chí lãnh đạo và quản lý đứng đầu cần phải quán triệt tinh thần Nghị quyết Trung ương 6 (khóa XI) trong việc nâng cao nhận thức về vai trò của khoa học và công nghệ, nghiên cứu khoa học, coi phát huy khoa học, xây dựng kế hoạch nghiên cứu, ứng dụng và phát triển đội ngũ cán bộ nghiên cứu khoa học làm một phần không thể thiếu, là nội dung quan trọng trong hoạt động của cơ quan.

Ba là, Hội đồng khoa học các cơ quan Đảng Trung ương phải là nơi đi đầu trong đổi mới mạnh mẽ, đồng bộ cơ chế nghiên cứu khoa học bao gồm cả trong công tác quản lý, tổ chức, hoạt động, từ việc lựa chọn, thẩm định, xét duyệt, giao đề tài đến việc tổ chức triển khai hoạt động nghiên cứu, đánh giá, nghiệm thu các kết quả nghiên cứu.

Bốn là, các cơ quan Đảng Trung ương, Hội đồng khoa học các cơ quan Đảng Trung ương cần chú trọng tiếp tục phối hợp kiện toàn tổ chức cơ quan quản lý khoa học các cấp để hoàn thành tốt nhiệm vụ được giao. Các cơ quan Đảng Trung ương phải tích cực tham gia vào công tác đào tạo, xây dựng đội ngũ cán bộ, nhất là đội ngũ cán bộ trẻ, coi đây là biện pháp quan trọng, hữu hiệu để nâng cao chất lượng nguồn nhân lực của đơn vị, ngành.

Đồng chí Đinh Thế Huynh cũng bày tỏ tin tưởng và hy vọng hoạt động khoa học các cơ quan Đảng  Trung ương sẽ tiếp tục đổi mới sáng tạo, hiệu quả và mạnh mẽ hơn.

Thay mặt Hội đồng Khoa học các cơ quan Đảng Trung ương, đồng chí Phùng Hữu Phú, Chủ tịch Hội đồng, tiếp thu ý kiến chỉ đạo và bày tỏ quyết tâm tiếp tục đổi mới, nâng cao chất lượng, hoạt động hiệu quả của Hội đồng trong năm 2014 và những năm tiếp theo.