Trường đại học Nông lâm, Trường đại học Bách khoa, Khu Nông nghiệp Công nghệ cao (CNC) đã hình thành ba mô hình vườn ươm với các hệ thống hỗ trợ tư vấn, kỹ thuật và dịch vụ đi kèm. Theo Sở KH và CN TP Hồ Chí Minh, các vườn ươm đều đã thiết lập hoàn chỉnh cơ sở hạ tầng và trang thiết bị văn phòng, hệ thống thông tin, bước đầu hình thành cơ cấu tổ chức và mạng lưới đối tác cung ứng dịch vụ cho hoạt động ươm tạo. Các doanh nghiệp được ươm tạo đều tập trung vào các lĩnh vực ưu tiên của thành phố như CNTT, cơ khí nông nghiệp, cơ điện tử, nhiên liệu sinh học... Các vườn ươm cũng có nhiều hoạt động liên kết như đào tạo, tư vấn và chia sẻ kinh nghiệm tổ chức, điều hành trong nước và nước ngoài.

Hiện nay, mỗi vườn ươm đều có năm doanh nghiệp đang ở giai đoạn đầu của quá trình ươm tạo. Dự kiến thời gian tới, mỗi vườn ươm xét tuyển hai đến ba doanh nghiệp mới hằng năm. Các doanh nghiệp tham gia ươm tạo đều định hướng phát triển trở thành doanh nghiệp KHCN.

Theo Sở KH và CN TP Hồ Chí Minh, hoạt động ươm tạo doanh nghiệp công nghệ vẫn còn khá mới ở Việt Nam. Trong khi đội ngũ cán bộ quản lý chưa có nhiều kinh nghiệm, công tác tuyên truyền chưa đi vào chiều sâu, sự phối hợp giữa các bên có liên quan còn rời rạc, chưa đồng bộ. Các vườn ươm đều đang hoạt động ở giai đoạn đầu của quá trình ươm tạo nên chưa đánh giá được hiệu quả hoạt động của vườn ươm. Một số vườn ươm còn chậm hình thành pháp nhân, bộ máy và cơ chế điều hành, trùng lặp hoạt động giữa các vườn ươm. Nguồn tài chính đầu tư cho vườn ươm hiện nay chủ yếu từ ngân sách Nhà nước và trường đại học cho nên còn hạn chế và mang tính chất thử nghiệm. Ngoài ra, hầu hết các vườn ươm đều do cán bộ kiêm nhiệm, chất lượng đầu vào hạn chế, cơ sở hạ tầng... chưa đạt yêu cầu. Vườn ươm khu Nông nghiệp CNC thì xa trung tâm thành phố nên cũng rất khó khăn trong việc thu hút doanh nghiệp đến ươm tạo.

Theo Giám đốc Công ty TNHH Phương Nam (thuộc Vườn ươm Khu Nông nghiệp CNC) Phạm Xuân Hùng, doanh nghiệp hiện rất cần được hỗ trợ về kinh phí để triển khai công nghệ sản xuất, về thông tin KHCN để cập nhật những công nghệ mới trong lĩnh vực hoạt động, sau khi kết thúc thời gian ươm tạo cần tiếp tục có những ưu đãi để phát triển. Giám đốc Vườn ươm đại học Bách khoa TP Hồ Chí Minh Mai Thanh Phong cho rằng, phải nâng cao được nhận thức cho doanh nghiệp về vườn ươm. Hiện nay, hoạt động vườn ươm ở các trường đại học còn rất manh mún, nhỏ lẻ. Do vậy, điều quan trọng là phải tìm hướng đi để vườn ươm phát triển được bền vững.