Trong số này, "trường phái Hà Nội" của Viện Toán học đã được thế giới công nhận và hiện nay Việt Nam đứng thứ 19 trong xếp hạng của thế giới và đứng đầu khối ASEAN về tối ưu. Trong vật lý, các nhà khoa học Việt Nam đã đi theo hướng nghiên cứu hiện đại và liên ngành như: thông tin lượng tử, quang học lượng tử, nanô... giúp ngành vật lý đứng thứ 64 thế giới và thứ 3 khối ASEAN. Năm 2009-2010, các nhà khoa học Việt Nam đang triển khai một số nghiên cứu cơ bản định hướng ứng dụng trong lĩnh vực công nghệ nanô, điện tử y sinh, giải mã hệ gen người Việt Nam, hướng đến ứng dụng công nghệ cao trong dược phẩm, chẩn đoán và điều trị bệnh, tiến tới tiếp cận với trình độ quốc tế.

Bộ KHCN cho biết thêm, giai đoạn 2006-2010, lĩnh vực khoa học tự nhiên đã công bố được 1.045 bài báo trên các tạp chí khoa học chuyên ngành quốc tế, 1.163 báo cáo tại các hội nghị khoa học quốc tế, xuất bản 133 sách chuyên khảo, góp phần đào tạo 1.304 học viên cao học và 548 tiến sỹ. Hai ngành có nhiều công trình công bố nhất trên tạp chí quốc tế có uy tín là toán học (360 công trình) và ngành vật lý (322).