Ngân hàng này có 1.430 chủng (gồm 860 chủng vi sinh vật gây bệnh phân lập từ bệnh nhân và môi trường bệnh viện, 100 chủng vi khuẩn tả, 300 chủng vi khuẩn lao kháng thuốc, 50 chủng nấm candida gây bệnh…); 100 mẫu vi sinh vật khó nuôi, 3 mẫu vi khuẩn đặc biệt nguy hiểm, trên 500 mẫu kháng huyết thanh... Ngân hàng đã bước đầu phát huy tác dụng trong phục vụ huấn luyện, nghiên cứu, tạo panel kiểm định và kit chẩn đoán các mầm bệnh.